Kindinar Mescidi, Kindinar Kilisesi ve Kindinar Şapeli isimleriyle anılan yapı, daha sonra Fatih Küçük Camii olarak adlandırılmıştır. Yapı, Bizans kilisesinden camiye çevrilen yapılar arasındadır. Yazılı kaynaklara göre yapının en erken 1523-1553 tarihleri arasında mescide dönüştürüldüğü bilinmektedir. Yığma yapım sistemiyle inşa edilen yapıda kesme taş ve moloz malzeme kullanılmıştır. Yapı, harim, son cemaat yeri ve kadınlar mahfilinden oluşmaktadır. Yapı tek nefli ve nefin sonunda tek apsislidir. Apsis dış cepheden beş kenarlıdır. Camiye çevrildikten sonra bir mihrap ve minber eklenmiştir. Yapının mevcut girişi kuzey portalindendir. Bu girişin batısına, duvar bitişiğine minare eklenmiştir. Yakın zamanda batı duvarı kaldırılarak yapılan ek binanın zemin katı halen kadınlar mahfili olarak kullanılmaktadır. Yapının kuzey cephesindeki giriş kapısı tek kanatlı, ahşap ve yuvarlak kemerlidir. Yazılı kaynaklara göre, yapının orijinal apsis pencereleri yerini ve biçimini korumakla birlikte, karakteristik söveli, basık kemerli güney pencereleri dönüştürüldükten sonra açılmıştır. İç mekânda duvarlar günümüzde sıvalı ve beyaz boyalı olup süsleme mevcut değildir. Minber ve vaaz kürsüsü ahşap malzemeden yapılmış olup sadedir. Zengin süslemeli mihrabı mukarnaslı ve bitkisel motiflidir. Yapının dıştan üst örtüsü kırma çatıdır. Çatı malzemesi Alaturka kiremittir.